1916年3月，宋慶齡和孫中山自日本返回上海。自此以后將近10年中，孫中山繼續領導革命，其間數度蟄居上海，著書立說，或開赴廣州，主持政務，夫婦常在一起。宋慶齡與孫中山在一起工作，她“輝煌的頭腦，充實了她丈夫的頭腦，完全了他更偉大的人格。”
當他們回國后，孫中山南下廣州任大元帥，領導第一次護法運動。由于受到軍閥和政客的排擠，憤而辭去大元帥職務。這時孫中山困居上海，一籌莫展，極度苦悶，好似陷入絕望境地。宋慶齡對孫中山在生活上悉心照料，在精神上鼓勵孫中山振作起來。
宋慶齡深知孫中山愛好讀書，隨時幫助他收集有價值的書和報刊雜志，協助孫中山查閱資料，著書立說。從1918—1919年間，孫中山閉門謝客，撰寫文稿，決心改變現狀。這期間的著作，都包含著宋慶齡的心血。她還幫助孫中山起草許多電函稿，作英文翻譯，勤勤懇懇地盡到秘書的職責。她還加緊學習德文、俄文，為和蘇聯聯系做準備。孫中山和宋慶齡對列寧十分欽佩。這期間，宋慶齡多次幫助孫中山與蘇聯聯系。1918年，孫中山與列寧開始往來電函。1922年，列寧和孫中山之間第一次建立了直接聯系。宋慶齡說：“在通信往來當中，這兩位偉大的革命戰士在爭取人類自由和進步的斗爭中攜起了手來。”
