海協、海基兩會是兩岸當局的授權管道，所以兩會關系是兩岸關系的最具體反映。臺灣《中央日報》網絡報今日刊載點評文章表示，兩會關系是基于兩岸的“九二共識”，目前朝野兩黨對“九二共識”的認同與否完全相反，因此，一旦明年政黨又輪替，兩會關系就勢必回到過去曾經發生過的停滯狀態。
不妨檢視2008年5月國民黨重新執政以來，海協、海基兩會的互動績效。從那時起到今年10月底，海基會組團赴大陸參訪22次，海協會組團來臺10次，共32次。而在2004年11月到2008年4月，雙方的互動是零。
點評指出，2008年5月以來，海基會接待大陸來臺團體551團，還接待海外團體349團，總計900團。而在2004年11月到2008年4月，連一個訪問海基會的大陸團體都沒有，同一期間，來訪的海外團體僅13團，這是因為兩岸關系緊張，海外人士來訪意愿降低。
2008年5月以來，海基會接到海協會函3541件，而在2004年11月到2008年4月，只接到23件，亦即在等量的時間里，國民黨執政是民進黨執政的154倍。
2008年5月以來，大陸人士赴臺觀光是273.8萬人，而在2004年11月到2008年4月，僅28.8萬人；前者比后者成長了851％。兩岸直航方面，國民黨重新執政以來，兩岸飛行了74000個航班。而上一次民進黨執政期間，兩岸之間僅飛行了數十個節日直航航班。
點評指出，臺灣民眾所重視的兩岸共同打擊犯罪方面，2008年5月以來，大陸遣返臺灣通緝犯151人；兩岸合作偵破51案，逮補嫌疑犯3027人。而上一次民進黨執政期間，大陸遣返的臺灣通緝犯僅僅數人。
至于兩會領導人的協商簽約，國民黨重新執政后的兩岸兩會商談共計7次，簽署了16項協議。而上一次民進黨執政期間，兩會領導人見不了面，也未曾簽署協議。除非有人認為上述兩會積極推動互動對臺灣不利，否則兩會互動不僅是所有臺灣民眾所支持，也是國際社會所樂見。而認同“九二共識”與否的政黨執政，則決定兩會是否能有正常往來。
