2001年1月2日，時(shí)任金門(mén)縣縣長(zhǎng)陳水在率領(lǐng)180名金門(mén)鄉(xiāng)親，乘坐金門(mén)“太武”號(hào)、“浯江”號(hào)兩艘客輪，從金門(mén)直航廈門(mén)。這是廈金兩地隔絕半個(gè)多世紀(jì)后的首次正式直航，拉開(kāi)了廈金“小三通”的序幕。

　　2002年2月9日—10日，由廈門(mén)市臺(tái)商協(xié)會(huì)牽頭組織的289名在閩臺(tái)商及眷屬，分兩批通過(guò)廈金“小三通”航線返臺(tái)過(guò)年。這是50多年來(lái)臺(tái)胞首次大規(guī)模經(jīng)廈金“小三通”返臺(tái)過(guò)年。

　　2004年12月7日，福建居民經(jīng)廈金“小三通”赴金門(mén)旅游正式啟動(dòng)，首批3個(gè)旅游團(tuán)組共55人乘坐廈金“小三通”客輪“同安”號(hào)前往金門(mén)旅游。

　　2006年10月，廈金“小三通”單月旅客人數(shù)達(dá)6萬(wàn)多人次，首次超過(guò)臺(tái)胞當(dāng)月經(jīng)港澳中轉(zhuǎn)往來(lái)大陸的人數(shù)。

　　2008年6月19日，從臺(tái)灣本島經(jīng)廈金“小三通”到福建旅游的第一個(gè)團(tuán)組80人，從臺(tái)北出發(fā)，經(jīng)金門(mén)乘船抵達(dá)廈門(mén)。

　　2010年，廈金“小三通”航線邁入雙向行李托運(yùn)服務(wù)的新階段，往返兩岸的旅客更輕松、便利。

　　2013年，正式啟動(dòng)在廈暫住居民經(jīng)廈金航線赴金門(mén)旅游天數(shù)由1日延長(zhǎng)至2日，為游客提供更加多元的選擇。

　　2001

　　2001年1月6日，居住在福建省的91名金門(mén)籍同胞，乘坐“鼓浪嶼”號(hào)客輪，從廈門(mén)直航金門(mén)。這是在閩金門(mén)籍同胞與金門(mén)故鄉(xiāng)、親人隔絕50多年后，首次乘船直達(dá)故土探親。

　　2002年2月27日，廈門(mén)國(guó)貿(mào)集團(tuán)租用的廈門(mén)“中洲”號(hào)貨輪，運(yùn)載金門(mén)所需的1940噸沙石等建筑材料，從廈門(mén)直航金門(mén)。這是相隔50多年后廈門(mén)首次向金門(mén)直運(yùn)貨物。

　　2002

　　2002年6月7日，廈金“小三通”首次為來(lái)福建探親時(shí)舊病復(fù)發(fā)的79歲臺(tái)胞饒永江，開(kāi)辟了“生命救助綠色通道”。

　　2005

　　2005年4月，臺(tái)灣電機(jī)電子同業(yè)工會(huì)經(jīng)貿(mào)團(tuán)近200人，取道廈金“小三通”來(lái)廈門(mén)參加“臺(tái)交會(huì)”。這是第一個(gè)獲準(zhǔn)經(jīng)金門(mén)直航廈門(mén)的臺(tái)灣大型經(jīng)貿(mào)團(tuán)組。

　　2008年9月25日，時(shí)任中共廈門(mén)市委書(shū)記何立峰率廈門(mén)市委赴臺(tái)參訪團(tuán)一行26人，經(jīng)金門(mén)赴臺(tái)參訪。這是大陸第一個(gè)經(jīng)“小三通”航線赴臺(tái)開(kāi)展交流活動(dòng)的團(tuán)組。

　　2009

　　2009年5月15日，廈門(mén)贈(zèng)送金門(mén)“五緣”號(hào)躉船，開(kāi)創(chuàng)廈金交流先河。

　　2012

　　2012年6月17日，廈金航線夜航航班正式開(kāi)通，這是兩岸首次開(kāi)通夜航航班。

　　2015

　　2015年1月1日，金門(mén)對(duì)大陸居民赴金旅游實(shí)施落地簽政策，在金門(mén)口岸填寫(xiě)申請(qǐng)，繳交600臺(tái)幣，即可入境停留15天，赴金旅游更加便利。